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This September, Fauna & Flora International (FFI) and BCOMING took on a very special campaign: The Cambodia Takeover series, bringing attention to the vital work that is being carried out in the country. Every Thursday, we’ve explored different facets of Cambodia’s unique biodiversity, highlighting Fauna & Flora’s work while fostering a deeper understanding of the country’s natural heritage. Through this collaboration, we wanted to show the incredible work being done by FFI and how it ties into the broader goals of the BCOMING project. 

Le projet BCOMING vise à réaliser une évaluation approfondie de la biodiversité à travers différents gradients et échelles anthropiques. Au Cambodge, l'équipe scientifique se concentre sur l'interface chauve-souris en tant qu'élément clé, non seulement pour évaluer le risque zoonotique, mais aussi pour comprendre les dynamiques écologiques plus larges. Les communautés d'ectoparasites des chauves-souris, qui jouent un rôle important dans la santé de l'écosystème des chauves-souris et dans la dynamique de transmission des maladies entre elles, font partie des caractéristiques évaluées. Les chauves-souris hébergent un large éventail d'ectoparasites, notamment des puces, des mouches, des tiques et des acariens, et font partie intégrante des relations complexes entre les chauves-souris, leurs hôtes et l'environnement. Bien que souvent négligés, ces ectoparasites semblent être des composants écologiques essentiels et peuvent servir d'indicateurs de la santé des écosystèmes. Bien que mal compris, ces ectoparasites, en changeant occasionnellement d'hôte, pourraient faciliter la transmission de maladies infectieuses au sein des colonies de chauves-souris. Deux familles, les Streblidae et les Nycteribiidae, se distinguent par leurs adaptations et leurs comportements uniques au sein de l'écosystème des chauves-souris.

Dans le cadre du projet BCOMING en Guinée, le CERFIG a organisé une mission sur le terrain du 12 au 27 janvier 2024, pour capturer des rongeurs et prélever des échantillons de chauves-souris dans la grotte de Samyankhouré, sous-préfecture de Madina-Oula.

Les mammifères, composants vitaux des écosystèmes terrestres, font face à des déclins drastiques en raison des changements anthropogènes dans les paysages. Avec de nombreuses espèces isolées dans des zones protégées et confrontées à un statut de conservation extrême, il est de plus en plus nécessaire de disposer de méthodes rapides, rentables et non-invasives pour surveiller leurs populations. Au sein de BCOMING, il est important que nous utilisions les techniques les plus précises pour établir l'évaluation de la biodiversité, car elle est une composante essentielle de nos recherches sur la circulation des agents pathogènes. Notre équipe de l'Université de Liège en Belgique, composée de la Dr Pauline van Leeuwen et du Prof. Johan Michaux, s’est plongée dans la littérature scientifique à la recherche de méthodes non-invasives pour détecter les espèces de mammifères sur le terrain. Ils ont publié le premier article scientifique soutenu par le consortium BCOMING. Cette étude compare les méthodes d'inventaire conventionnelles et la technique émergente de metabarcoding de l'ADN environnemental (eADN) pour l'évaluation de la biodiversité des mammifères.

Au cœur de l'Asie du Sud-Est se trouve le Cambodge, un pays regorgeant de biodiversité qui a depuis longtemps captivé l'imagination des biologistes. Nichée au sein de cette riche tapisserie d'écosystèmes, une équipe de recherche de l'Université de Liège s’est lancé dans un voyage passionnant pour dévoiler les mystères du microbiome de la faune cambodgienne à l'interface homme-animal. Notre équipe à l'Université de Liège en Belgique, composée de la Dr Pauline van Leeuwen et du Prof. Johan Michaux, est à la tête de la composante microbiome du projet BCOMING. Nous visons à améliorer notre connaissance de l'influence de la biodiversité sur la structure des microbiomes et les risques zoonotiques.

Our journey to Samyankhouré led us to meet with the Prefect and his staff to finalize mission orders. Accompanied by the Deputy Director General of Agriculture and Livestock for Kindia, we greeted local authorities before settling into our campsite. The authorities expressed gratitude for our conservation efforts in their area.

Our journey from N'Zérékoré to Macenta led us to the Prefect's residence, where we completed administrative formalities. With the Deputy Prefectural Director of Agriculture and Livestock, we met community representatives at a workshop organized by Fauna et Flora Internationale. Despite the absence of local authorities due to a training course, we received encouragement for our wildlife monitoring efforts.

Mission Overview: Our team embarked on the fourth field mission organized by CERFIG from November 10th to 29th, 2023, as part of the BCOMING project. The primary objectives were to investigate, capture, and sample rodents while continuing the ecological monitoring of bats in the Samyankhouré cave in Guinea's Kindia prefecture.

Le 13 décembre (2023), MERFI a organisé un atelier au cours duquel Alex Smajgl a présenté le projet de modèle ABM et son interface. La présentation a été suivie d'une discussion. 

Le 12 décembre (2023), Cherie a présenté les résultats de sa première année de recherche sur l'optimisation de la surveillance des virus zoonotiques chez les chauves-souris à l'aide de modèles mécanistes. Pour ce faire, elle a utilisé les données collectées par Julien et son équipe pendant quatre ans en collaboration avec l'IPC. Reconnaissant la transmission potentielle de divers virus des chauves-souris à l'homme, Cherie a souligné l'importance de la surveillance des chauves-souris. 

Dans le cadre du projet BCOMING, j'ai eu l'occasion de visiter le Cambodge pour la première fois, un pays qui m'a toujours intéressé par son mélange unique d'histoire ancienne, de passé sobre, de vie urbaine trépidante et de marchés de rue animés. 

Bats constitute a large proportion of Cambodia’s mammal fauna with 83 species currently confirmed in the kingdom (Furey et al. 2021, Csorba & Furey 2022, Furey unpubl. data). This figure will almost certainly increase with further research in the country’s under-studied border regions. Roughly half of the species presently known to occur in Cambodia comprise species that are frequently found in caves and other subterranean sites and because these bats spend at least half their lives inside caves, protection of such sites is essential for their conservation.