Exploration de la biodiversité et de la dynamique des maladies zoonotiques en Guinée

L'équipe sur le terrain était composée d'agents de la Direction Nationale des Services Vétérinaires (DNSV), notamment du Laboratoire Central Vétérinaire de Diagnostic (LCVD), de l'Office Guinéen des Parcs Nationaux et Réserves de Faune (OGPNRF), et du CERFIG/CIRAD. La mission s'est déroulée dans les préfectures de Faranah (Tindo) et Kindia (sous-préfecture de Madina-Oula, districts de Samyankhouré). Les objectifs de la mission étaient les suivants :

• Enquêter en capturant et en prélevant des échantillons de rongeurs dans les villages et leurs environs pour mieux comprendre les liens entre la perte de biodiversité et l'émergence de maladies zoonotiques, dans le but de limiter leur propagation grâce à des stratégies de conservation et à la surveillance des maladies d'origine animale.

• Poursuivre le suivi écologique des chauves-souris dans la grotte de Samyankhouré, en capturant et prélevant des échantillons de chauves-souris pour mieux comprendre la dynamique de transmission des virus au sein de ce groupe, notamment des coronavirus.

• Continuer à rechercher des excréments d'animaux sauvages dans et autour de la grotte pour identifier d'éventuelles voies de contamination par les chauves-souris.

Composition de l'équipe:

1. M. Souana GOUMOU, Zoologiste, Assistant Technique au CERFIG, Chef de mission
2. Dr Grégoire PEREZ, Écologue de la santé (CIRAD)
3. Sous-lieutenant Aboubacara DIALLO, Conservateur de la nature (OGPNRF)
4. M. Moussa DOUMBOUYA (Biologie)
5. M. Abdoulaye MANET, Chauffeur (CERFIG)

Localisation de la Mission: Préfectures de Faranah (Tindo) et Kindia (Samyankhouré).

Rencontres avec les Autorités Locales: L'équipe a effectué les formalités administratives à la Direction Préfectorale de l'Agriculture et de l'Élevage dès son arrivée. Plus tard, elle s'est rendue à la résidence du Préfet avant de se rendre à Tindo, où elle a été accueillie par les autorités locales. Des formalités ont été menées avant de commencer les activités.

Capture et Prélèvement de Rongeurs à Tindo: L'équipe a déployé 100 pièges dans le village de Tindo et ses environs. Ils ont capturé 60 rongeurs sur trois nuits, euthanasiés conformément au protocole pour ceux capturés dans les villages.

Prélèvement Non-Invasif et Faune Sauvage: Vingt échantillons de fèces par bâche ont été collectés à l'intérieur de la grotte de Samyankhouré. En raison d'un feu de brousse, les populations de chauves-souris ont diminué, affectant les résultats de l'échantillonnage.

Prélèvements de Chauves-Souris: Vingt-trois chauves-souris ont été capturées et échantillonnées. L'équipe a observé une baisse du nombre de chauves-souris, probablement due au feu de brousse.

Capture et Prélèvement de Rongeurs à Samyankhouré: Cent pièges ont été posés dans le village de Samyankhouré et ses environs, capturant 30 rongeurs sur trois nuits. L'euthanasie a été réalisée pour les rongeurs capturés dans les villages.

Dans l'ensemble, la mission visait à étudier la dynamique des maladies zoonotiques et à renforcer les efforts de conservation de la biodiversité en Guinée.