Démêler la tapisserie de la biodiversité cambodgienne

La Dr Pauline van Leeuwen et l'étudiante vétérinaire Alix Nicolas ont entrepris une mission pour réaliser des évaluations exhaustives de la biodiversité en collectant des échantillons environnementaux qui offriront un aperçu du monde caché prospérant au sein des habitats du pays. Ces échantillons permettront d'éclairer les relations complexes entre différentes espèces et leur environnement. Cette session sur le terrain s'est déroulée en décembre 2023 en collaboration avec l'Institut Pasteur du Cambodge (IPC) dans la province de Stung Treng.

Au cœur de leur méthodologie de recherche se trouve l'utilisation de l'ADN environnemental. Cette approche novatrice implique l'extraction du matériel génétique laissé par les organismes dans leur environnement, fournissant un moyen non intrusif et très sensible de détecter et d'identifier les espèces. En analysant l'ADN environnemental en collaboration avec des partenaires de Nature Metrics, l'équipe de recherche peut révéler une mine d'informations sur la biodiversité présente au Cambodge, y compris des espèces insaisissables et menacées qui peuvent être difficiles à observer directement. Dans ce cadre, l'équipe a collecté des échantillons de sol et de surface de feuilles lors d'une expédition commune avec l'Institut Pasteur du Cambodge (IPC). Pendant que l'équipe de l'IPC échantillonne des chauves-souris pour la surveillance des agents pathogènes, notre équipe de l'ULiège a mis en place différents 'pièges' d'ADN environnemental pour comparer différentes stratégies d'échantillonnage. Ils ont mis en place un système de pièges à poils non-invasifs, un système appâté permettant aux rongeurs et petits mammifères de traverser un tube et de laisser des poils derrière eux pour une analyse génétique. Les petits mammifères sont d'un intérêt particulier dans le projet BCOMING, et il est important de savoir quelles espèces sont en contact avec les humains, ainsi que les chauves-souris dans nos sites d'échantillonnage.

Le deuxième axe clé de la recherche de l'Université de Liège est de dénouer les intricacités du microbiome de la faune cambodgienne. Les microbes jouent un rôle crucial dans le maintien de la santé des écosystèmes, influençant tout, de la circulation des nutriments à l'équilibre global de l'environnement. Même à l'intérieur des hôtes, ils peuvent limiter l'expansion des agents pathogènes microbiens par la 'résistance à la colonisation'. À travers leurs travaux sur le terrain, l'équipe cherche à comprendre comment les communautés microbiennes interagissent avec la faune du Cambodge, contribuant à l'équilibre délicat de ces écosystèmes. Lors de la session sur le terrain de décembre 2023 avec l'IPC dans la province de Stung Treng, nous avons réussi à collecter de nombreux échantillons fécaux de chauves-souris qui seront utilisés pour étudier ces communautés microbiennes.

À travers le prisme de l'ADN environnemental et d'un engagement envers la collaboration, les efforts de l'équipe de l'ULiège contribuent non seulement à la connaissance scientifique, mais aussi aux efforts continus de sauvegarde des merveilles naturelles du Cambodge pour les générations futures.