Voyage au Cambodge (2/3)

Jour 2 - Résultats de Cherie sur l'optimisation de la surveillance des virus zoonotiques chez les chauves-souris

Le 12 décembre (2023), Cherie a présenté les résultats de sa première année de recherche sur l'optimisation de la surveillance des virus zoonotiques chez les chauves-souris à l'aide de modèles mécanistes. Pour ce faire, elle a utilisé les données collectées par Julien et son équipe pendant quatre ans en collaboration avec l'IPC. Reconnaissant la transmission potentielle de divers virus des chauves-souris à l'homme, Cherie a souligné l'importance de la surveillance des chauves-souris. 
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Cherie a présenté différentes méthodes d'échantillonnage des chauves-souris pour recueillir des données, y compris des techniques invasives telles que les écouvillons rectaux, les écouvillons salivaires et les prélèvements sanguins, qui sont coûteux et nécessitent beaucoup de main-d'œuvre. En revanche, les techniques non invasives telles que la collecte de guano sont plus rentables mais fournissent moins de données. 

Il est essentiel de trouver une méthode de surveillance qui maximise les résultats et minimise les coûts. C'est là que les modèles entrent en jeu. Le doctorat de Cherie porte sur les modèles compartimentaux mécanistes qui décrivent les processus dans le temps à l'aide de relations mathématiques. Les modèles peuvent être calibrés sur des données de terrain à l'aide de techniques bayésiennes. Les résultats peuvent inclure des estimations de l'incertitude des paramètres biologiques et des trajectoires. 

 

Fig.1 : Cherie Yu présente ses résultats 

 

L'une des questions clés est de savoir si la saisonnalité de la reproduction des chauves-souris peut prédire la dynamique des coronavirus. Les recherches existantes suggèrent que la dynamique des virus transmis par les chauves-souris est fortement influencée par l'écologie des chauves-souris. Des rapports indiquent qu'il existe une excrétion et une infection virales saisonnières chez les chauves-souris. Les naissances synchronisées chez les chauves-souris créent des conditions favorables à la transmission virale, car l'afflux de juvéniles naïfs amplifie la circulation et l'affaiblissement des anticorps maternels contribue à un pic infectieux. 

Cherie continuera d'affiner son modèle, et au fur et à mesure que les résultats du projet BCOMING seront disponibles, elle les intégrera dans le modèle. 

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